Pada tahun 2019, kepentingan untuk memperkuat pertahanan Indonesia mendorong Prabowo untuk menerima undangan untuk bergabung dalam Kabinet Indonesia Maju sebagai Menteri Pertahanan. Di bawah kepemimpinan Prabowo, pembangunan pertahanan Indonesia mengalami percepatan yang signifikan. Sekarang, Indonesia memiliki komponen cadangan yang terlatih, industri pertahanan yang terkonsolidasi, produk pertahanan yang diekspor meningkat, dan diplomasi pertahanan yang semakin kuat. Prabowo juga fokus pada peningkatan kualitas sumber daya pertahanan Indonesia dengan langkah-langkah seperti peningkatan kualitas pendidikan di Universitas Pertahanan (UNHAN), mendirikan Fakultas Kedokteran Militer, serta membuka lebar pintu beasiswa bagi putera-puteri bangsa untuk berkuliah di UNHAN.
Selain itu, Prabowo juga memberikan perhatian khusus untuk SMA Taruna Nusantara di Magelang. Dia berusaha untuk menjadikan SMA TN kembali menjadi sekolah unggulan terbaik di Indonesia dengan peningkatan fasilitas dan kurikulum. Prabowo juga membentuk komponen cadangan sesuai dengan amanat UU 23/2019 tentang Pengelolaan Sumber Daya Nasional (PSDN) untuk Pertahanan Negara.
Prabowo juga bergerak cepat dalam menghadapi pandemi Covid-19 dengan meningkatkan kapasitas ruang rawat inap dan ICU di Pusat Rehabilitasi (Pusrehab) Kemhan RS Dr. Suyoto, serta mendatangkan obat-obatan dan membuat alat penunjang seperti ventilator dan Alat Pelindung Diri (APD). Dalam pengakuan atas jasanya, Prabowo menerima penghargaan Darjah Utama Bakti Cemerlang (Tentera) dari Pemerintah Singapura.
Dibawah kepemimpinan Prabowo, diplomasi pertahanan Indonesia semakin kuat dengan penyelesaian kesepakatan kerjasama pertahanan yang saling menguntungkan dengan negara-negara kunci. Terjadi peningkatan statuta Indonesia yang terlihat dari peningkatan hubungan dengan negara-negara sahabat dan peningkatan diplomasi pertahanan.
Prabowo juga aktif dalam forum internasional sebagai Menteri Pertahanan RI. Dia juga terlibat dalam upaya pencarian KRI Nanggala 402 yang hilang kontak, dengan berkoordinasi dengan negara-negara sahabat yang menawarkan bantuan. Prabowo juga memberikan perhatian kepada keluarga prajurit yang gugur dalam tugas, dengan memberikan bantuan dan dukungan maksimal.
Prabowo juga fokus pada pengembangan industri pertahanan dalam negeri dan meningkatkan kerjasama dengan BUMN dalam bidang pertahanan. Dia juga aktif berkoordinasi dengan parlemen dan lembaga terkait untuk merencanakan pembangunan kekuatan pertahanan Indonesia untuk 25 tahun ke depan.
Sebagai Menteri Pertahanan, Prabowo turun langsung memastikan bahwa sarana dan prasarana yang dibutuhkan oleh TNI AD, TNI AL, dan TNI AU dalam kondisi prima. Atas dedikasi dan loyalitasnya, Prabowo diberi gelar Warga Kehormatan oleh Korps Brimob Polri. Prabowo juga mendorong industri pertahanan Indonesia untuk terus menjalankan manajemen yang terbaik.
Prabowo juga telah meresmikan sejumlah titik bantuan air bersih dan rumah sakit di berbagai daerah di Indonesia. Kolaborasi antara Kementerian Pertahanan dan Universitas Pertahanan juga dilakukan dalam upaya peningkatan pelayanan kesehatan untuk prajurit dan masyarakat umum.
